音，早已候在堂侧的陈伯平立即开始行动。他掏炸弹，猛地向恩铭掷去。但炸弹在地上了几，却没有爆炸。恩铭惊起大叫。

徐锡麟说：“大帅勿惊，有革命党！职为大帅拿！”

恩铭喝：“什么人？”

徐锡麟并不回答，弯腰从靴筒手枪两把，一手握了一把，然后正：“正是职也！”

恩铭惊骇不已，语不达意：“会办拿枪什么？难要呈验吗？”

话音未落，枪声已经响起。徐锡麟扣动扳机，连连朝恩铭去，据宗汉回忆，恩铭到达后，“徐锡麟叫我同陈伯平到东边房，恩抚台到堂上来，我合（和）陈伯平站在房门外，闻有枪声，知是锡麟开放，陈伯平拖我衣，令跟他一同来，陈伯平也把枪开放”。

枪声一响，现场大。礼堂的官员首先炸了营，四狂奔。此时，恩铭已经中弹倒地，幸得边的文武巡捕上前施救。恩铭手文武巡捕均为亲信。文巡捕名叫陆养颐，武巡捕名叫车德文。他们背起受伤的恩铭向外退去。

据陶成章记述，徐锡麟本意是先杀死恩铭，再其左右，不料他睛度近视，开枪之后不知是否打中，便向恩铭放。陈伯平和宗汉这时也冲上来，举枪急。不少官员中弹倒，血迸溅，一片鬼哭狼嚎。文巡捕陆养颐用护住恩铭，中多枪，武巡捕车德文也多受伤。如果不是徐锡麟弹打尽，恩铭很难逃脱。乘着徐锡麟弹打完，回屋装弹时，恩铭被属背礼堂。不过，在他逃礼堂时，陈伯平又追上来放了一枪。这一枪打中了恩铭的尾闾，并上穿心际，造成致命伤害。

关于恩铭逃走有两说法：一说是车德文带伤唤来大轿王某，将恩铭背走；另一说法是藩司冯煦命戈什将恩铭负。不论哪说法准确，总之恩铭逃离现场时十分狼狈。左右仓促之间将他轿，来不及将他放好，轿夫们便抬起轿开跑。据目击者称，恩铭“两足拖于轿外”，一路逃奔，被抬回抚署。

恩铭逃走后，各级官员也四奔逃，作鸟兽散。有的向前门奔去，有的由后院翻墙而遁。在混中，收支委员顾松也被打死。

由于枪击发生在礼堂，礼堂外的学生们一开始并不明白发生了什么，只听枪声四起，各官吏四散逃奔，后又听说有刺客，并不知是徐锡麟所为。及至看到徐锡麟等人从礼堂里追杀来，误以为是在抓刺客。等到恩铭等人逃走之后，茫然无措的学生们才从混中回过神来。徐锡麟一边令集合，一边刀大呼：“抚台被刺，我们去捉细，快随我革命！”

直到这时，徐锡麟仍然糊其辞，没有说明起义的真相，只是希望乘裹挟学生们起事。他一边声称“捉细”，一边又说“快随我革命”，这本就自相矛盾，学生们也是一雾，既惊愕又茫然。但不容他们多想，徐锡麟已令整队，并令学生们到大堂上领取枪支弹药。有的学生不愿去，陈伯平便手拿双枪，迫学生们收拢到一起。徐锡麟说：“我们警察有保护治安责任，不能私逃，逃者即杀！”